بسیاری از گونه‌های جانوری که در ماداگاسکار زندگی می‌کنند تنها بومی این منطقه هستند و نمی‌توان حتی یک نمونه از آن‌ها را در جایی دیگر از این کره خاکی یافت. فودی ماداگاسکاری، قورباغه گوجه فرنگی، گکو دم برگی شیطانی، آفتاب پرست پلنگی، پروانه دم دراز، فوسا و لمور‌های ماداگاسکار برخی از جانوران بومی این منطقه به شمار می‌آیند.